北京市已公布并实施从总体规划到控制性详细规划的多层级规划文件。北京中轴线的保护管理体系由遗产地整体和遗产构成要素两个层次构成。在遗产地层面，北京市已成立北京市推进全国文化中心建设领导小组，由市领导牵头，负责统筹中央、北京市、区等多个政府层级，及文物、规划、文化与旅游、园林绿化、交通、水务等多方面业务部门协商议事，协同、落实遗产保护相关重大事项。北京中轴线遗产保护中心负责执行、落实具体决策，以及遗产监测、档案管理等日常管理工作。遗产影响评估和灾害应对机制已纳入遗产管理体系。

对北京中轴线的定义始于20世纪50年代。虽然中国古代城市规划受到“择中”的传统观念和《考工记》所载理想都城规划范式的影响，自魏晋时期就存在都城中轴线的规划手法，但在历史文献中未明确使用“中轴线”一词。1951年，中国著名建筑师、建筑历史学家与城市规划师——梁思成在其论文《北京——都市计划中的无比杰作》中首次提出“中轴线”的概念，界定了由钟鼓楼至永定门的传统北京中轴线范围，并从规划范围、景观形态、建筑美学等方面对其特点进行了描述。此后，“中轴线”的概念被广泛使用于各类学术研究当中。

在遗产构成要素层面，15处遗产构成要素均已建立专门的遗产管理机构，具体负责遗产的日常维护、保护、监测、研究和展示等工作的实施。北京中轴线的保护也得到多方利益相关者的积极支持，他们切实参与到遗产保护管理的决策制定过程之中。